Biología computacional para mejorar el diseño de fármacos
El Premio Ramon Margalef del Consejo Social de la UB ha sido para una investigación en el ámbito de la biología computacional. Concretamente, el galardón lo ha logrado Sergio Ruiz por desarrollar un método alternativo y más eficiente para diseñar medicamentos. Se trata de una forma nueva de identificar moléculas que sean punto de partida de futuros fármacos al tener altas posibilidades de acoplarse a las proteínas diana, las encargadas de controlar la acción de los fármacos en el organismo.
El Premio Ramon Margalef del Consejo Social de la UB ha sido para una investigación en el ámbito de la biología computacional. Concretamente, el galardón lo ha logrado Sergio Ruiz por desarrollar un método alternativo y más eficiente para diseñar medicamentos. Se trata de una forma nueva de identificar moléculas que sean punto de partida de futuros fármacos al tener altas posibilidades de acoplarse a las proteínas diana, las encargadas de controlar la acción de los fármacos en el organismo.
Los métodos para predecir si una molécula se unirá a la proteína de interés se basan en la afinidad, es decir, en la estabilidad termodinámica del complejo. La investigación premiada parte, en cambio, de que las moléculas forman complejos estructuralmente estables (rígidos), y que es posible distinguir entre complejos activos e inactivos simplemente viendo cuánto cuesta romper algunas interacciones concretas. De este modo, se analiza cómo se rompen determinados complejos molécula-proteína diana para obtener moléculas más estables en dicha unión. «Ello se reflejaría en una mejora de la afinidad y de la acción terapéutica», explica Sergio Ruiz.
Investigación contra el cáncer y la COVID-19
Este método de diseño de fármacos complementa a los ya existentes y permite multiplicar su eficacia. El trabajo, publicado en portada en Nature Chemistry, se ha aplicado a diversas investigaciones, como «la búsqueda de posibles fármacos para actuar sobre una proteína involucrada en el cáncer», precisa Sergio Ruiz. Actualmente, el investigador desarrolla su labor en el Baker Heart and Diabetes Institute (Australia): «Sigo aplicando los métodos desarrollados durante mi doctorado en diversos proyectos, uno de los cuales consiste en buscar posibles tratamientos para la COVID-19».
Desde su posición actual, Ruiz afirma que su trayectoria en la UB ha sido esencial para poder desarrollar la investigación que le interesa y conocer otros estilos de ciencia en el extranjero. «Mi tesis doctoral, dirigida por el profesor Xavier Barril, de la Facultad de Farmacia y Ciencias de la Alimentación, y miembro del Instituto de Biomedicina de la Universidad de Barcelona (IBUB), fue una experiencia enriquecedora en todos los sentidos, no solo en el ámbito científico», concluye.
Artículo de referencia:
Sergio Ruiz-Carmona, Peter Schmidtke, F. Javier Luque, Lisa Baker, Natalia Matassova, Ben Davis, Stephen Roughley, James Murray, Rod Hubbard y Xavier Barril. «Dynamic undocking and the quasi-bound state as tools for drug discovery». Nature Chemistry, marzo de 2017. Doi: https://doi.org/10.1038/nchem.2660