Química analítica del DNA quadruplex
Esperem que trobis útil aquesta informació.
Som coautors d'un centenar d'articles publicats en revistes internacionals avaluades per experts (peer review). La majoria tracten l'estudi dels equilibris conformacionals dels àcids nucleics mitjançant tècniques espectroscòpiques i quimiomètriques. Els articles més recents descriuen els equilibris en solució de les seqüències de DNA que formen el G-quadruplex i l'i-motif. La investigació anterior es va centrar, principalment, en els equilibris que impliquen homopolinucleòtids com ara àcids poli(C), poli(I) o poli(U), i mescles d'aquests. Paral·lelament a l'estudi dels equilibris en solució del DNA, l'esforç també s'ha centrat en el desenvolupament de mètodes quimiomètrics, com l'aplicació de l'anàlisi multivariant a l'anàlisi de dades de matrius de DNA.
Aquí trobaràs una presentació que inclou alguns exemples de la nostra recerca.
A ResearchGate hi ha una llista completa de tots aquests articles, dels quals es poden sol·licitar còpies. Igualment, a Google Scholar hi ha disponible informació detallada sobre les nostres publicacions.
Enric Font (Universitat de Barcelona, 2024). Estudiant de màster. Treballa en la detecció de seqüències riques en pirimidines mitjançant nanoclústers de plata fluorescents estabilitzats per DNA.
Carlos Poyato (Universitat de Barcelona, 2023). Treballa en la detecció de seqüències riques en pirimidines mitjançant nanoclústers de plata fluorescents estabilitzats per DNA.
Pavel Hannig (Universitat Masaryk, Brno, República Txeca, 2023). Ha estat treballant en la interacció d'alcaloides naturals amb diverses estructures de DNA.
Javier Pacheco (Universitat de Barcelona, 2022). Ha estat treballant en la detecció de seqüències riques en pirimidines mitjançant nanoclústers de plata fluorescents estabilitzats per DNA.
Laila Bchara (Universitat de Barcelona, 2022). Ha estat treballant en l'aplicació de l'electroforesi capil·lar a l'estudi d'estructures i-motif.
Katerina Kolkova (Universitat Masaryk, Brno, República Txeca, 2021). Ha estat treballant en la interacció d'alcaloides naturals amb estructures de DNA G-quadruplex, i-motif i duplex.
David Reguera (Universitat de Barcelona, 2020). Ha estat treballant en l'aplicació de DNA triplex ric en citosines a la determinació de miRNA mitjançant la tecnologia de nanoclústers.
Alejandra de la Hoz (Universitat de Barcelona, 2019). Va cursar el màster en Química Analítica. Treballava en l'aplicació de seqüències de DNA riques en citosines a la tecnologia de nanoclústers de plata.
Alba Navarro (Universitat de Barcelona, 2018). Va cursar el màster en Química Analítica. Treballava en l'aplicació de seqüències de DNA riques en citosines a la tecnologia de nanoclústers de plata.
Juan Fernando García (Universitat de Barcelona, 2017). Estudiant equatorià del màster en Química Analítica. Va treballar en l'aplicació de seqüències de DNA riques en citosines a la tecnologia de nanoclústers de plata.
Petra Jarosová (Universitat Masaryk, Brno, República Txeca, 2016). Ha estat treballant en la interacció d'alcaloides naturals amb estructures G-quadruplex.
Gerard Pastor (Universitat de Barcelona, 2016). Ha estat treballant en la formació i les característiques espectrals de nanoclústers de plata estabilitzats per seqüències de DNA riques en citosines.
Ewa Rajczak (Universitat Adam Mickiewicz, Poznan, Polònia, 2015). Ha estat treballant en l'estudi de la interacció de metallacrowns amb estructures G-quadruplex.
Adam Midlik (Universitat Masaryk, Brno, República Txeca, 2015). Ha estat treballant en l'aplicació de mètodes multivariant a l'anàlisi de dades espectroscòpiques registrades al llarg de la fusió d'estructures de DNA triplex.
Sergio Benito (Universitat de Barcelona, 2014). Va treballar en l'aplicació de la cromatografia d'exclusió per grandària i l'espectrometria de masses a l'estudi dels equilibris de plegament d'una seqüència de formació de G-quadruplex prop de la regió promotora del gen c-KIT.
Petr Paroulek (Universitat Masaryk, Brno, República Txeca, 2013). Ha col·laborat amb nosaltres en l'estudi de la interacció d'alcaloides naturals amb DNA G-quadruplex.
Michal Rájecký (Universitat Masaryk, Brno, República Txeca, 2012). Ha col·laborat amb nosaltres en l'estudi de la interacció d'alcaloides amb DNA duplex.
Sanae Benabou (Universitat de Barcelona, 2012-). Ha estat treballant en els equilibris en solució de dues seqüències riques en citosines i guanines situades a prop de la regió promotora de NMI. Va defensar amb èxit el màster el febrer del 2013, i va obtenir el doctorat l'any 2018.
Sara Ruiz Castelar (Universitat de Barcelona, 2011). Ha col·laborat amb nosaltres en l'estudi dels equilibris en solució de seqüències riques en guanines mitjançant mètodes espectroscòpics i cromatogràfics.
Andrea Barba (Universitat de Barcelona). Ha col·laborat amb nosaltres en l'estudi dels equilibris en solució d'una seqüència del gen KRAS mitjançant tècniques espectroscòpiques i electroforètiques.
Sintayehu Manaye (màster europeu en Qualitat als Laboratoris Analítics, Etiòpia, 2009). Va col·laborar amb nosaltres, durant el període 2009-2010, en l'estudi dels equilibris en solució d'una seqüència rica en guanines que es troba a les regions promotores de l'oncogèn c-KIT. Així mateix, va estudiar la interacció d'aquestes seqüències amb lligands basats en porfirines (com ara TMPyP4 o NMM).
Pavel Bucek (Universitat Masaryk, Brno, República Txeca, 2008). Va col·laborar amb nosaltres, del 2007 al 2009, en l'estudi dels equilibris en solució de dues seqüències riques en guanines i en citosines que es troben a les regions promotores dels oncogens BCL2 i c-KIT. Així mateix, va estudiar la interacció d'aquestes dues seqüències amb lligands basats en porfirines (com ara TMPyP4).
Miquel del Toro Carrion (Universitat de Barcelona, 2008). Va treballar durant un any en l'estudi de l'estructura G-quadruplex formada per l'aptòmer d'unió a la trombina (TBA) i la seva interacció amb la porfirina TMPyP4. En aquesta tasca, va aplicar mètodes espectroscòpics (com ara l'absorció molecular, el dicroisme circular o la fluorescència molecular), la ressonància de plasmó de superfície i l'HPLC. Va defensar el màster el març del 2008.
Dr. Joaquim Jaumot Soler (Universitat de Barcelona). Va obtenir el doctorat el 2006 amb la tesi Nous desenvolupaments, aplicacions bioanalítiques i validació dels mètodes de resolució multivariant.
Dra. Montserrat Vives Blazquez (Universitat de Barcelona). Va obtenir el doctorat el 2003 amb la tesi Estudio de los cambios conformacionales de ácidos nucleicos y de su interacción con compuestos de interés farmacológico.
Dr. Jordi Iglesias Yagüe (Universitat de Barcelona). Va obtenir el màster l'any 1998 amb el treball Application of in-situ methodologies for the study of the acid-base and complexation equilibria of 1,10-phenanthroline and derivatives. Més tard, es va doctorar a la Universitat d'Innsbruck (Àustria).
Bruna Estrella Casas (Universitat de Barcelona, 2025). Estudia la interacció d'un derivat de la cianina amb seqüències de DNA riques en citosines.
Jianhao Wang niversitat de Barcelona, 2025). Va estudiar la interacció d'un derivat de la cianina amb seqüències de DNA riques en citosines en el marc d'una estada per a estudiants del grau.
Ona Raset (Universitat de Barcelona, 2024). Va treballar en la interacció d'un derivat de la cianina amb estructures G-quadruplex i i-motif.
Hamzah Ahmed (Universitat de Warwick, Regne Unit, 2024). Ha estat treballant en la interacció de nous tints fluorescents amb estructures secundàries de DNA mitjançant tècniques espectroscòpiques.
Judit Rodríguez (Universitat de Barcelona, 2022). Va estudiar els equilibris conformacionals de les estructures híbrides i-motif-duplex, així com la interacció de diversos lligands amb aquestes estructures.
Andrea Valls (Universitat de Barcelona, 2022). Va treballar en la detecció de seqüències riques en pirimidines mitjançant nanoclústers de plata estabilitzats per DNA.
Noelia Ruiz (Universitat de Barcelona, 2019). Va treballar en l'estudi de la interacció dels alcaloides naturals amb les estructures de DNA.
Laura Aillon (Universitat de Barcelona, 2018). Va treballar en l'electroquímica de les estructures de DNA.
Oriol Oliva (Universitat de Barcelona, 2017). Va treballar en l'estudi de la influència dels cations metàl·lics i els lligands orgànics en les estructures i-motif.
Víctor Duque (Universitat de Barcelona, 2016). Va treballar en l'estudi de la influència dels cations metàl·lics en les estructures i-motif.
Alba Ferrer (Universitat de Barcelona, 2015). Va treballar en l'estudi dels equilibris en solució de diverses seqüències riques en guanines corresponents al gen SMARCA4.
Gerard Pastor (Universitat de Barcelona, 2014). Va treballar en l'estudi dels equilibris en solució de diverses seqüències riques en guanines corresponents al gen SMARCA4.
Joan Josep Alba (Universitat de Barcelona, 2014). Va estudiar els equilibris en solució de diverses seqüències riques en citosines corresponents al gen SMARCA4.
Daniel García (Universitat de Barcelona, 2014). Ha estat treballant en l'estudi de la interacció de diversos tints amb estructures de DNA quadruplex mitjançant espectroscòpia de fluorescència molecular.
Anna Sadurní (Universitat de Barcelona, 2013). Va treballar en l'estudi de la influència de bases situades als llaços en l'estabilitat de les estructures de formació d'i-motif.
Ferran Sabaté (Universitat de Barcelona, 2012). Va estudiar la formació de nanopartícules de plata i la interacció amb DNA rics en citosines.
Sergio Fernández (Universitat de Barcelona, 2010). Va estudiar els equilibris àcid-base i tèrmics de diverses seqüències riques en citosines mitjançant mètodes espectroscòpics.
Irene Giner (Universitat de Barcelona, 2010). Ha estat treballant en l'aplicació de l'electroforesi capil·lar per estudiar els equilibris en solució del DNA.
Sanae Benabou (Universitat de Barcelona). Ha estat treballant en l'aplicació de l'electroforesi capil·lar per estudiar els equilibris en solució del DNA.
Agnieszka Stępień (Universitat Adam Mickiewicz, Polònia). Ha col·laborat amb nosaltres en l'estudi dels equilibris en solució d'una de les seqüències de fomació d'i-motif a l'oncogèn KRAS.
Nicolas Roucou (Institut Universitari de Tecnologia de Lannion, França, 2008). Va treballar durant tres mesos en els equilibris en solució d'una de les seqüències de formació d'i-motif a l'oncogèn c-KIT. També va participar en l'estudi de la interacció d'aquestes seqüències amb lligands basats en porfirina (com ara TMPyP4).
Terézia Vojtylová (Universitat de Brno, República Txeca). Va estudiar els equilibris conformacionals d'una seqüència de DNA rica en citosines que es troba a la regió promotora de l'oncogèn BCL2. Es van afegir diverses bases d'adenina per estudiar-ne la influència en l'estabilitat de les estructures i-motif potencials formades per aquesta seqüència.
Verónica Hernando (Universitat de Barcelona, 2007). Va fer un període de recerca durant el qual va estudiar els equilibris conformacionals de seqüències de DNA riques en citosines. Va començar a emprar l'HPLC per investigar aquests equilibris.
Nasiruddin Khan (Gonda, Índia, 2006). Va fer un període de recerca en què va començar a estudiar els equilibris en solució de G-quadruplex i i-motif al nostre laboratori. Concretament, va investigar els equilibris en solució de dues seqüències riques en guanines i en citosines que es troben a la regió promotora de l'oncogèn BCL2.
Katarzyna Wrona (Universitat dels Jagellons de Cracòvia, Polònia). Va fer un període de recerca l'any 2005, durant el qual va estudiar la interacció de l'actinomicina D (ACTD) amb oligonucleòtids portadors de la seqüència central -XGCY-.
Roger Ramos (Universitat de Barcelona). Va fer un període de recerca l'any 2005, durant el qual va estudiar els equilibris àcid-base i la cinètica de l'ACTD. Posteriorment, va fer un màster a l'IBMB-CSIC (amb el Dr. Eritja), en què va treballar en nanoestructures de DNA.
Guillaume Loiret (Institut Universitari de Tecnologia de Lannion, França). Va fer un període de recerca l'any 2005, durant el qual va investigar la intercalació de derivats d'acridina en el DNA.
Alexandre Lekernec (Institut Universitari de Tecnologia de Lannion, França). Va fer un període de recerca l'any 2004, en què va estudiar la interacció de l'ACTD amb oligonucleòtids portadors de la seqüència central -XGCY-.
Sílvia Sánchez (Universitat de Barcelona). Va fer un període d'investigació l'any 2004, durant el qual va treballar en els equilibris àcid-base i conformacionals de llaços i oligonucleòtids formadors de triplex (TFO).
Petr Taborsky (Universitat Masaryk, Brno, República Txeca). Va fer un període de recerca l'any 2000, durant el qual va treballar en els equilibris àcid-base i conformacionals dels DNA que contenien la base modificada 2-aminopurina. Ara és professor ajudant a la Universitat Masaryk, i encara col·labora amb nosaltres en l'aplicació de l'espectroscòpia de fluorescència a l'estudi dels àcids nucleics.